完成後、暖炉を設置したい場合、壁を突き抜けて煙突をだすことは可能ですか？

可能ですが条件があります。
これは暖炉に限らずエアコンやＦＦ式の暖房器具なども同じ事が言えますが、壁や屋根には筋交いなどの構造上重要な部材が入っています。
この部材を壊さない様に施工するため、穴をあけて配管して終わりと言う様なおろそかな施工はできません。
したがって、施工する際はご相談いただくことをお勧めします。
新築やリフォームの際はなるべく最初の計画時に将来、暖房器具をつける位置を決めていただけますと、あらかじめ対処可能な施工をさせていただいております。